Authors: Fan S, Yuan P, Li S, Li H, Zhai B, Li Y, Zhang H, Gu J, Li H, Tian Y, Kang X, Zhang Y, Li G
(Contact: YHZhang@henau.edu.cn; liguoxi0914@126.com ) Affiliation: College of Animal Science and Technology, Henan Agricultural University, No.15 Longzihu University Area, Zhengzhou New District, Zhengzhou, 450002, China. Title: Genetic architecture and key regulatory genes of fatty acid composition in Gushi chicken breast muscle determined by GWAS and WGCNA. Journal: BMC Genomics, 24(1): 434 (2023)
DOI :
10.1186/s12864-023-09503-1 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Polyunsaturated fatty acid content
Chr.1 : Asso:285039 , Asso:285040 , Asso:285041 , Asso:285047 , Asso:285117 . Chr.2 : Asso:285032 , Asso:285033 , Asso:285046 . Chr.4 : Asso:285036 . Chr.6 : Asso:285048 , Asso:285135 . Chr.7 : Asso:285028 . Chr.9 : Asso:285052 . Chr.13 : Asso:285026 , Asso:285027 , Asso:285029 , Asso:285045 . Chr.17 : Asso:285034 , Asso:285038 . Chr.21 : Asso:285035 .
QTL for Fatty acid atherogenic index
Chr.2 : Asso:285058 , Asso:285120 , Asso:285140 , Asso:285168 , Asso:285169 . Chr.4 : Asso:285054 , Asso:285060 , Asso:285064 , Asso:285065 , Asso:285072 , Asso:285086 , Asso:285087 , Asso:285104 , Asso:285109 , Asso:285127 , Asso:285143 , Asso:285144 , Asso:285150 , Asso:285152 , Asso:285159 , Asso:285167 , Asso:285170 . Chr.5 : Asso:285030 , Asso:285031 , Asso:285050 , Asso:285051 , Asso:285063 , Asso:285081 , Asso:285094 , Asso:285096 , Asso:285097 , Asso:285100 , Asso:285154 .
QTL for Saturated fatty acid content
Chr.1 : Asso:285131 , Asso:285132 . Chr.2 : Asso:285037 , Asso:285077 , Asso:285080 , Asso:285114 , Asso:285122 , Asso:285138 , Asso:285139 , Asso:285151 , Asso:285155 , Asso:285162 , Asso:285165 . Chr.11 : Asso:285078 . Chr.13 : Asso:285079 , Asso:285091 , Asso:285092 , Asso:285093 , Asso:285136 , Asso:285148 .
QTL for Eicosatrienoic acid content
Chr.1 : Asso:285107 . Chr.4 : Asso:285053 , Asso:285056 , Asso:285066 , Asso:285074 , Asso:285076 , Asso:285116 . Chr.5 : Asso:285146 , Asso:285166 . Chr.7 : Asso:285130 . Chr.21 : Asso:285042 , Asso:285059 , Asso:285085 . Chr.27 : Asso:285044 , Asso:285071 , Asso:285084 , Asso:285115 , Asso:285137 , Asso:285158 , Asso:285164 .
QTL for Heptadecanoic acid content
Chr.2 : Asso:285133 , Asso:285134 . Chr.3 : Asso:285043 , Asso:285049 , Asso:285055 , Asso:285067 , Asso:285068 , Asso:285069 , Asso:285070 , Asso:285082 , Asso:285095 , Asso:285113 , Asso:285149 , Asso:285163 . Chr.5 : Asso:285160 .
QTL for Eicosenoic acid content
Chr.2 : Asso:285083 . Chr.3 : Asso:285121 . Chr.5 : Asso:285161 . Chr.7 : Asso:285111 , Asso:285124 . Chr.8 : Asso:285141 , Asso:285156 . Chr.13 : Asso:285057 , Asso:285098 , Asso:285103 , Asso:285105 . Chr.17 : Asso:285099 , Asso:285102 , Asso:285125 , Asso:285145 , Asso:285147 , Asso:285153 , Asso:285173 , Asso:285174 .
QTL for Fatty acid average chain length
Chr.12 : Asso:285119 . Chr.13 : Asso:285061 , Asso:285062 , Asso:285088 , Asso:285089 .
QTL for Docosahexaenoic acid content
Chr.7 : Asso:285108 . Chr.8 : Asso:285075 . Chr.13 : Asso:285073 , Asso:285101 .
QTL for Oleic acid content
Chr.1 : Asso:285090 . Chr.4 : Asso:285106 , Asso:285110 , Asso:285118 , Asso:285126 , Asso:285129 , Asso:285157 . Chr.33 : Asso:285171 , Asso:285172 .
QTL for Erucic acid content
Chr.3 : Asso:285112 . Chr.5 : Asso:285123 , Asso:285128 , Asso:285142 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (9) ,
Chr.2 (22) ,
Chr.3 (14) ,
Chr.4 (30) ,
Chr.5 (18) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (5) ,
Chr.8 (3) ,
Chr.9 (1) ,
Chr.11 (1) ,
Chr.12 (1) ,
Chr.13 (20) ,
Chr.17 (10) ,
Chr.21 (4) ,
Chr.27 (7) ,
Chr.33 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Fan S, Yuan P, Li S, Li H, Zhai B, Li Y, Zhang H, Gu J, Li H, Tian Y, Kang X, Zhang Y, Li G (2023). Genetic architecture and key regulatory genes of fatty acid composition in Gushi chicken breast muscle determined by GWAS and WGCNA.. BMC Genomics, 24(1): 434;
Curated into QTLdb on 2023-10-03. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=QkWs8W7TsN
OR
Fan S, Yuan P, Li S, Li H, Zhai B, Li Y, Zhang H, Gu J, Li H, Tian Y, Kang X, Zhang Y, Li G (2023). Genetic architecture and key regulatory genes of fatty acid composition in Gushi chicken breast muscle determined by GWAS and WGCNA.. BMC Genomics, 24(1): 434; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/s12864-023-09503-1
