Authors: Olsen HG, Knutsen TM, Kohler A, Svendsen M, Gidskehaug L, Grove H, Nome T, Sodeland M, Sundsaasen KK, Kent MP, Martens H, Lien S
(Contact: hanne-gro.olsen@nmbu.no ) Affiliation: Centre for Integrative Genetics (CIGENE), Department of Animal and Aquacultural Sciences, Norwegian University of Life Sciences, PO Box 5003, 1432, Ås, Norway Title: Genome-wide association mapping for milk fat composition and fine mapping of a QTL for de novo synthesis of milk fatty acids on bovine chromosome 13 Journal: Genetics, Selection, Evolution : GSE, 49(1): 20 (2017)
DOI :
10.1186/s12711-017-0294-5 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Milk capric acid content
Chr.1 : Asso:126202 . Chr.10 : Asso:126203 , Asso:126204 , Asso:126205 . Chr.13 : Asso:126206 , Asso:126207 , Asso:126208 , Asso:126397 , Asso:126403 , Asso:126411 , Asso:126417 , Asso:126428 , Asso:126434 , Asso:126484 , Asso:126490 , Asso:126494 , Asso:126500 , Asso:126506 , Asso:126512 , Asso:126524 , Asso:126529 , Asso:126534 , Asso:126539 , Asso:126545 , Asso:126549 . Chr.15 : Asso:126209 , Asso:126210 , Asso:126211 , Asso:126212 , Asso:126213 . Chr.22 : Asso:126214 .
QTL for Milk lauric acid content
Chr.1 : Asso:126215 . Chr.10 : Asso:126216 , Asso:126217 . Chr.13 : Asso:126218 , Asso:126219 , Asso:126398 , Asso:126404 , Asso:126412 , Asso:126429 , Asso:126435 , Asso:126481 , Asso:126485 , Asso:126495 , Asso:126501 , Asso:126507 , Asso:126513 , Asso:126525 , Asso:126530 , Asso:126535 , Asso:126540 , Asso:126550 . Chr.15 : Asso:126220 , Asso:126221 , Asso:126222 , Asso:126223 , Asso:126224 . Chr.22 : Asso:126225 .
QTL for Milk myristic acid content
Chr.10 : Asso:126226 , Asso:126227 . Chr.13 : Asso:126228 , Asso:126229 , Asso:126399 , Asso:126405 , Asso:126413 , Asso:126418 , Asso:126430 , Asso:126436 , Asso:126486 , Asso:126496 , Asso:126502 , Asso:126508 , Asso:126514 , Asso:126526 , Asso:126531 , Asso:126536 , Asso:126541 , Asso:126551 . Chr.15 : Asso:126230 , Asso:126231 , Asso:126232 , Asso:126233 , Asso:126234 . Chr.17 : Asso:126235 . Chr.22 : Asso:126236 .
QTL for Milk myristoleic acid content
Chr.6 : Asso:126237 , Asso:126238 , Asso:126239 , Asso:126240 , Asso:126241 , Asso:126242 , Asso:126243 . Chr.9 : Asso:126244 , Asso:126245 , Asso:126246 . Chr.11 : Asso:126247 , Asso:126248 . Chr.14 : Asso:126249 , Asso:126250 , Asso:126251 . Chr.19 : Asso:126252 .
QTL for Milk pentadecylic acid content
Chr.1 : Asso:126253 . Chr.2 : Asso:126254 . Chr.5 : Asso:126255 . Chr.17 : Asso:126256 . Chr.23 : Asso:126257 .
QTL for Milk palmitic acid content
Chr.17 : Asso:126258 .
QTL for Milk palmitoleic acid content
Chr.15 : Asso:126259 . Chr.16 : Asso:126260 .
QTL for Milk stearic acid content
Chr.6 : Asso:126261 . Chr.9 : Asso:126262 . Chr.11 : Asso:126263 . Chr.15 : Asso:126264 , Asso:126265 , Asso:126266 . Chr.24 : Asso:126267 .
QTL for Milk oleic acid content
Chr.8 : Asso:126268 . Chr.15 : Asso:126269 , Asso:126270 , Asso:126271 . Chr.17 : Asso:126272 . Chr.26 : Asso:126273 , Asso:126274 .
QTL for Milk trans-10-Octadecenoic acid content
Chr.5 : Asso:126275 . Chr.9 : Asso:126276 , Asso:126277 . Chr.10 : Asso:126278 . Chr.23 : Asso:126279 .
QTL for Milk trans-vaccenic acid content
Chr.1 : Asso:126280 , Asso:126281 .
QTL for Milk trans-9-Octadecenoic acid content
Chr.6 : Asso:126282 , Asso:126283 , Asso:126284 , Asso:126285 , Asso:126286 , Asso:126287 . Chr.24 : Asso:126288 , Asso:126289 .
QTL for Milk linoleic acid content
Chr.1 : Asso:126290 . Chr.6 : Asso:126291 , Asso:126292 . Chr.10 : Asso:126293 . Chr.20 : Asso:126294 .
QTL for Milk butyric acid content
Chr.9 : Asso:126295 . Chr.10 : Asso:126296 . Chr.13 : Asso:126297 . Chr.17 : Asso:126298 , Asso:126299 , Asso:126300 , Asso:126301 , Asso:126302 , Asso:126303 , Asso:126304 , Asso:126305 , Asso:126306 , Asso:126307 , Asso:126308 , Asso:126309 .
QTL for Milk caproic acid content
Chr.1 : Asso:126310 . Chr.8 : Asso:126311 . Chr.10 : Asso:126312 . Chr.13 : Asso:126313 , Asso:126314 , Asso:126315 , Asso:126395 , Asso:126401 , Asso:126407 , Asso:126409 , Asso:126415 , Asso:126420 , Asso:126422 , Asso:126424 , Asso:126426 , Asso:126432 , Asso:126438 , Asso:126440 , Asso:126482 , Asso:126488 , Asso:126492 , Asso:126498 , Asso:126504 , Asso:126510 , Asso:126522 , Asso:126547 . Chr.17 : Asso:126316 .
QTL for Milk caprylic acid content
Chr.1 : Asso:126317 . Chr.10 : Asso:126318 , Asso:126319 , Asso:126320 . Chr.13 : Asso:126321 , Asso:126322 , Asso:126323 , Asso:126396 , Asso:126402 , Asso:126408 , Asso:126410 , Asso:126416 , Asso:126421 , Asso:126423 , Asso:126425 , Asso:126427 , Asso:126433 , Asso:126439 , Asso:126441 , Asso:126442 , Asso:126443 , Asso:126483 , Asso:126489 , Asso:126493 , Asso:126499 , Asso:126505 , Asso:126511 , Asso:126516 , Asso:126517 , Asso:126518 , Asso:126519 , Asso:126520 , Asso:126521 , Asso:126523 , Asso:126528 , Asso:126533 , Asso:126538 , Asso:126544 , Asso:126548 , QTL:126562 , QTL:126563 , QTL:126564 , QTL:126565 , QTL:126566 , QTL:126567 , QTL:126568 , QTL:126569 , QTL:126570 , QTL:126571 , QTL:126572 , QTL:126573 , QTL:126574 . Chr.15 : Asso:126324 , Asso:126325 .
QTL for Milk cis-vaccenic acid content
Chr.12 : Asso:126326 . Chr.23 : Asso:126327 .
QTL for Milk cis-fatty acid content
Chr.8 : Asso:126328 . Chr.15 : Asso:126329 , Asso:126330 . Chr.17 : Asso:126331 . Chr.26 : Asso:126332 .
QTL for Milk conjugated linoleic acid content
Chr.4 : Asso:126333 , Asso:126334 . Chr.5 : Asso:126335 , Asso:126336 . Chr.13 : Asso:126337 .
QTL for Milk cis-4,7,10,13,16,19-Docosahexaenoic acid content
Chr.1 : Asso:126338 . Chr.4 : Asso:126339 , Asso:126340 . Chr.7 : Asso:126341 . Chr.15 : Asso:126342 , Asso:126343 . Chr.16 : Asso:126344 .
QTL for Milk medium-chain fatty acid content
Chr.1 : Asso:126345 . Chr.10 : Asso:126346 , Asso:126347 , Asso:126348 . Chr.13 : Asso:126349 , Asso:126350 , Asso:126351 , Asso:126400 , Asso:126406 , Asso:126414 , Asso:126419 , Asso:126431 , Asso:126437 , Asso:126487 , Asso:126491 , Asso:126497 , Asso:126503 , Asso:126509 , Asso:126515 , Asso:126527 , Asso:126532 , Asso:126537 , Asso:126542 , Asso:126543 , Asso:126546 , Asso:126552 . Chr.15 : Asso:126352 , Asso:126353 , Asso:126354 , Asso:126355 , Asso:126356 . Chr.22 : Asso:126357 .
QTL for Milk iodine content
Chr.8 : Asso:126358 . Chr.15 : Asso:126359 , Asso:126360 . Chr.17 : Asso:126361 . Chr.26 : Asso:126362 .
QTL for Milk monounsaturated fatty acid content
Chr.17 : Asso:126363 . Chr.26 : Asso:126364 .
QTL for Milk omega-6 fatty acid content
Chr.1 : Asso:126365 . Chr.6 : Asso:126366 , Asso:126367 , Asso:126368 , Asso:126369 . Chr.9 : Asso:126370 . Chr.10 : Asso:126371 .
QTL for Milk polyunsaturated fatty acid content
Chr.1 : Asso:126372 . Chr.6 : Asso:126373 . Chr.9 : Asso:126374 . Chr.10 : Asso:126375 .
QTL for Milk saturated fatty acid content
Chr.5 : Asso:126376 . Chr.8 : Asso:126377 . Chr.17 : Asso:126378 , Asso:126379 . Chr.23 : Asso:126380 . Chr.26 : Asso:126381 , Asso:126382 .
QTL for Milk fat yield
Chr.1 : Asso:126383 . Chr.15 : Asso:126384 , Asso:126385 .
QTL for Milk trans-fatty acid content
Chr.12 : Asso:126386 . Chr.25 : Asso:126387 .
QTL for Milk trans-fatty acid to cis-fatty acid ratio
Chr.5 : Asso:126388 . Chr.15 : Asso:126389 , Asso:126390 . Chr.17 : Asso:126391 , Asso:126392 , Asso:126393 . Chr.23 : Asso:126394 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (13) ,
Chr.2 (1) ,
Chr.4 (4) ,
Chr.5 (6) ,
Chr.6 (21) ,
Chr.7 (1) ,
Chr.8 (5) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (19) ,
Chr.11 (3) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.13 (152) ,
Chr.14 (3) ,
Chr.15 (39) ,
Chr.16 (2) ,
Chr.17 (25) ,
Chr.19 (1) ,
Chr.20 (1) ,
Chr.22 (4) ,
Chr.23 (5) ,
Chr.24 (3) ,
Chr.25 (1) ,
Chr.26 (7) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Olsen HG, Knutsen TM, Kohler A, Svendsen M, Gidskehaug L, Grove H, Nome T, Sodeland M, Sundsaasen KK, Kent MP, Martens H, Lien S (2017). Genome-wide association mapping for milk fat composition and fine mapping of a QTL for de novo synthesis of milk fatty acids on bovine chromosome 13. Genetics, Selection, Evolution : GSE, 49(1): 20;
Curated into QTLdb on 2017-03-27. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=LwQi2T8JlW
OR
Olsen HG, Knutsen TM, Kohler A, Svendsen M, Gidskehaug L, Grove H, Nome T, Sodeland M, Sundsaasen KK, Kent MP, Martens H, Lien S (2017). Genome-wide association mapping for milk fat composition and fine mapping of a QTL for de novo synthesis of milk fatty acids on bovine chromosome 13. Genetics, Selection, Evolution : GSE, 49(1): 20; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/s12711-017-0294-5
