Authors: Onteru SK, Fan B, Du ZQ, Garrick DJ, Stalder KJ, Rothschild MF
(Contact: mfrothsc@iastate.edu ) Affiliation: Department of Animal Science and Center for Integrated Animal Genomics, Iowa State University, Ames, IA 50011, USA Title: A whole-genome association study for pig reproductive traits. Journal: Animal Genetics, 43(1): 18-26 (2012)
DOI :
10.1111/j.1365-2052.2011.02213.x Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Offspring number
Chr.X : QTL:18324 . Chr.1 : QTL:18060 , QTL:18061 , QTL:18070 , QTL:18115 , QTL:18218 , QTL:18219 , QTL:18220 , QTL:18221 , QTL:18238 , QTL:18239 , QTL:18240 , QTL:18268 , QTL:18269 , QTL:18270 , QTL:18271 , QTL:18272 , QTL:18290 , QTL:18291 , QTL:18292 . Chr.2 : QTL:18062 , QTL:18063 , QTL:18064 , QTL:18094 , QTL:18095 , QTL:18096 , QTL:18097 , QTL:18125 , QTL:18181 , QTL:18182 , QTL:18183 , QTL:18184 , QTL:18185 , QTL:18186 , QTL:18222 , QTL:18241 , QTL:18242 , QTL:18243 , QTL:18244 , QTL:18273 , QTL:18274 , QTL:18275 , QTL:18293 , QTL:18294 . Chr.3 : QTL:18065 , QTL:18066 , QTL:18088 , QTL:18089 , QTL:18116 , QTL:18126 , QTL:18127 , QTL:18187 , QTL:18188 , QTL:18194 , QTL:18223 , QTL:18224 , QTL:18276 , QTL:18277 , QTL:18295 , QTL:18296 . Chr.4 : QTL:18067 , QTL:18098 , QTL:18099 , QTL:18117 , QTL:18189 , QTL:18225 , QTL:18245 , QTL:18246 , QTL:18278 , QTL:18297 , QTL:18298 , QTL:18299 . Chr.5 : QTL:18071 , QTL:18118 , QTL:18128 , QTL:18279 . Chr.6 : QTL:18090 , QTL:18100 , QTL:18119 , QTL:18129 , QTL:18130 , QTL:18226 , QTL:18247 , QTL:18248 , QTL:18249 , QTL:18300 , QTL:18301 , QTL:18302 . Chr.7 : QTL:18190 , QTL:18195 , QTL:18303 , QTL:18304 , QTL:18305 . Chr.8 : QTL:18101 , QTL:18102 , QTL:18103 , QTL:18120 , QTL:18121 , QTL:18131 , QTL:18191 , QTL:18196 , QTL:18227 , QTL:18280 , QTL:18306 . Chr.9 : QTL:18104 , QTL:18105 , QTL:18228 , QTL:18229 , QTL:18250 , QTL:18251 , QTL:18252 , QTL:18253 , QTL:18254 , QTL:18255 , QTL:18281 , QTL:18307 , QTL:18308 . Chr.10 : QTL:18309 , QTL:18072 , QTL:18073 , QTL:18106 , QTL:18122 , QTL:18123 , QTL:18256 , QTL:18257 , QTL:18282 . Chr.11 : QTL:18074 , QTL:18310 , QTL:18311 . Chr.12 : QTL:18068 , QTL:18075 , QTL:18091 , QTL:18107 , QTL:18108 , QTL:18132 , QTL:18197 , QTL:18230 . Chr.13 : QTL:18076 , QTL:18077 , QTL:18078 , QTL:18079 , QTL:18080 , QTL:18081 , QTL:18082 , QTL:18083 , QTL:18084 , QTL:18085 , QTL:18133 , QTL:18134 , QTL:18198 , QTL:18199 , QTL:18200 , QTL:18201 , QTL:18202 , QTL:18203 , QTL:18204 , QTL:18205 , QTL:18206 , QTL:18207 , QTL:18208 , QTL:18231 , QTL:18258 , QTL:18259 , QTL:18260 , QTL:18261 , QTL:18262 , QTL:18283 , QTL:18312 , QTL:18313 , QTL:18314 . Chr.14 : QTL:18086 , QTL:18087 , QTL:18109 , QTL:18124 , QTL:18192 , QTL:18209 , QTL:18210 , QTL:18211 , QTL:18232 , QTL:18263 , QTL:18284 , QTL:18315 . Chr.15 : QTL:18092 , QTL:18093 , QTL:18110 , QTL:18111 , QTL:18135 , Asso:18212 , QTL:18233 , QTL:18234 , QTL:18235 , QTL:18264 , QTL:18265 , QTL:18266 , QTL:18285 , QTL:18316 , QTL:18317 . Chr.16 : QTL:18069 , QTL:18112 , QTL:18193 , QTL:18213 , QTL:18286 , QTL:18287 , QTL:18318 , QTL:18319 . Chr.17 : QTL:18113 , QTL:18136 , QTL:18137 , QTL:18138 , QTL:18214 , QTL:18215 , QTL:18216 , QTL:18217 , QTL:18267 , QTL:18288 , QTL:18289 , QTL:18320 , QTL:18321 , QTL:18322 . Chr.18 : QTL:18114 , QTL:18236 , QTL:18237 , QTL:18323 .
QTL for Gestation length
Chr.1 : QTL:18167 , QTL:18168 , QTL:18169 . Chr.2 : QTL:18139 , QTL:18140 , QTL:18141 , QTL:18142 , QTL:18143 , QTL:18144 . Chr.3 : QTL:18155 . Chr.4 : QTL:18145 , QTL:18146 . Chr.5 : QTL:18147 , QTL:18148 . Chr.6 : QTL:18156 , QTL:18157 , QTL:18158 , QTL:18159 . Chr.7 : QTL:18160 , QTL:18170 , QTL:18171 , QTL:18172 , QTL:18173 , QTL:18174 . Chr.9 : QTL:18149 , QTL:18161 , QTL:18175 , QTL:18176 . Chr.10 : QTL:18162 , QTL:18163 . Chr.11 : QTL:18150 , QTL:18164 . Chr.13 : QTL:18151 , QTL:18177 . Chr.14 : QTL:18178 , QTL:18179 . Chr.15 : QTL:18152 . Chr.16 : QTL:18153 , QTL:18154 . Chr.17 : QTL:18165 , QTL:18166 . Chr.18 : QTL:18180 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (1) ,
Chr.1 (22) ,
Chr.2 (30) ,
Chr.3 (17) ,
Chr.4 (14) ,
Chr.5 (6) ,
Chr.6 (16) ,
Chr.7 (11) ,
Chr.8 (11) ,
Chr.9 (17) ,
Chr.10 (11) ,
Chr.11 (5) ,
Chr.12 (8) ,
Chr.13 (35) ,
Chr.14 (14) ,
Chr.15 (16) ,
Chr.16 (10) ,
Chr.17 (16) ,
Chr.18 (5) .
Number of gene-based eQTL/associations:
