Authors: Michenet A, Barbat M, Saintilan R, Venot E, Phocas F
(Contact: alexis.michenet@jouy.inra.fr ) Affiliation: UMR GABI, INRA, AgroParisTech, Universite Paris-Saclay, Jouy-en-Josas, 78352, France Title: Detection of quantitative trait loci for maternal traits using high-density genotypes of Blonde d'Aquitaine beef cattle Journal: BMC Genetics, 17(1): 88 (2016)
DOI :
10.1186/s12863-016-0397-y Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Calving ease
Chr.1 : QTL:106429 , QTL:106430 , Asso:106485 . Chr.2 : Asso:106431 , QTL:106432 . Chr.3 : QTL:106486 . Chr.4 : QTL:106487 . Chr.5 : QTL:106488 . Chr.6 : QTL:106433 , QTL:106434 , QTL:106489 . Chr.7 : QTL:106490 . Chr.8 : QTL:106435 , QTL:106436 , QTL:106437 , QTL:106491 , QTL:106492 , QTL:106493 , QTL:106494 . Chr.9 : QTL:106438 , QTL:106495 , QTL:106496 . Chr.10 : QTL:106439 , QTL:106440 . Chr.11 : QTL:106497 , QTL:106498 . Chr.12 : QTL:106441 , QTL:106442 , QTL:106499 . Chr.13 : QTL:106443 , QTL:106444 , QTL:106445 , QTL:106500 . Chr.14 : Asso:106446 , QTL:106501 , QTL:106502 . Chr.15 : QTL:106447 , QTL:106448 , QTL:106449 . Chr.16 : QTL:106503 , QTL:106504 . Chr.17 : QTL:106505 , QTL:106506 . Chr.18 : QTL:106450 , QTL:106451 , QTL:106452 , QTL:106507 . Chr.19 : QTL:106453 . Chr.20 : QTL:106454 , QTL:106455 , QTL:106456 . Chr.21 : QTL:106457 . Chr.25 : QTL:106458 , QTL:106508 , QTL:106509 , QTL:106510 . Chr.26 : QTL:106459 , QTL:106460 . Chr.27 : QTL:106461 , QTL:106512 , QTL:106513 , QTL:106514 . Chr.28 : QTL:106515 . Chr.29 : QTL:106516 , QTL:106517 .
QTL for Pelvic area
Chr.1 : QTL:106462 . Chr.2 : QTL:106463 . Chr.3 : QTL:106464 . Chr.4 : QTL:106465 . Chr.5 : QTL:106466 . Chr.6 : QTL:106467 . Chr.7 : QTL:106468 , QTL:106469 , QTL:106470 . Chr.9 : QTL:106471 . Chr.11 : QTL:106472 . Chr.12 : QTL:106473 , QTL:106474 . Chr.15 : QTL:106475 . Chr.19 : QTL:106476 , QTL:106477 , QTL:106478 . Chr.22 : QTL:106479 . Chr.26 : QTL:106480 , QTL:106481 . Chr.28 : QTL:106482 , QTL:106483 . Chr.29 : QTL:106484 .
QTL for Milk yield
Chr.1 : QTL:106518 . Chr.3 : QTL:106519 , QTL:106520 , QTL:106521 , QTL:106522 . Chr.4 : QTL:106523 . Chr.5 : QTL:106524 , QTL:106525 , QTL:106526 . Chr.6 : QTL:106527 , QTL:106528 . Chr.7 : QTL:106529 , QTL:106530 , QTL:106531 , QTL:106532 . Chr.8 : QTL:106533 , QTL:106534 . Chr.9 : QTL:106535 . Chr.10 : QTL:106536 , QTL:106537 , QTL:106538 . Chr.11 : QTL:106539 . Chr.13 : QTL:106540 , QTL:106541 , QTL:106542 , QTL:106543 , QTL:106544 . Chr.16 : QTL:106545 . Chr.17 : QTL:106546 , QTL:106547 , QTL:106548 . Chr.19 : QTL:106511 , QTL:106549 , QTL:106550 . Chr.20 : QTL:106551 , QTL:106552 , QTL:106553 , QTL:106554 , QTL:106555 . Chr.21 : QTL:106556 . Chr.22 : QTL:106557 , QTL:106558 . Chr.23 : QTL:106559 . Chr.25 : QTL:106560 . Chr.26 : QTL:106561 , QTL:106562 , QTL:106563 . Chr.27 : QTL:106564 , QTL:106565 . Chr.28 : QTL:106566 , QTL:106567 . Chr.29 : QTL:106568 , QTL:106569 .
QTL for Udder swelling score
Chr.1 : QTL:106570 . Chr.4 : QTL:106571 , QTL:106572 , QTL:106573 , QTL:106574 , QTL:106575 . Chr.5 : QTL:106576 . Chr.6 : QTL:106577 , QTL:106578 , QTL:106579 , QTL:106580 , QTL:106581 , QTL:106582 , QTL:106583 , QTL:106584 . Chr.8 : QTL:106585 , QTL:106586 , QTL:106587 , QTL:106588 , QTL:106589 , QTL:106590 , QTL:106591 , QTL:106592 . Chr.10 : QTL:106593 , QTL:106594 , QTL:106595 , QTL:106596 , QTL:106597 . Chr.11 : QTL:106598 , QTL:106599 . Chr.12 : QTL:106600 , QTL:106601 , QTL:106602 , QTL:106603 . Chr.13 : QTL:106604 , QTL:106605 . Chr.14 : QTL:106606 , QTL:106607 . Chr.15 : QTL:106608 , QTL:106609 . Chr.17 : QTL:106610 . Chr.18 : QTL:106611 . Chr.19 : QTL:106612 . Chr.21 : QTL:106613 . Chr.22 : QTL:106614 , QTL:106615 . Chr.23 : QTL:106616 , QTL:106617 , QTL:106618 . Chr.24 : QTL:106619 , QTL:106620 . Chr.25 : QTL:106621 , QTL:106622 . Chr.26 : QTL:106623 . Chr.28 : QTL:106624 . Chr.29 : QTL:106625 .
QTL for Body weight
Chr.2 : QTL:106626 , QTL:106627 . Chr.3 : QTL:106628 , QTL:106629 . Chr.4 : QTL:106630 . Chr.6 : QTL:106631 , QTL:106632 , QTL:106633 . Chr.7 : QTL:106634 , QTL:106635 , QTL:106636 , QTL:106637 . Chr.8 : QTL:106638 . Chr.9 : QTL:106639 , QTL:106640 , QTL:106641 , QTL:106642 . Chr.10 : QTL:106643 . Chr.11 : QTL:106644 , QTL:106645 . Chr.12 : QTL:106646 . Chr.13 : QTL:106647 . Chr.14 : QTL:106648 . Chr.15 : QTL:106649 . Chr.16 : QTL:106650 , QTL:106651 , QTL:106652 . Chr.17 : QTL:106653 , QTL:106654 . Chr.18 : QTL:106655 , QTL:106656 . Chr.19 : QTL:106657 , QTL:106658 . Chr.20 : QTL:106659 , QTL:106660 , QTL:106661 . Chr.22 : QTL:106662 , QTL:106663 , QTL:106664 . Chr.23 : QTL:106666 , QTL:106667 . Chr.24 : QTL:106668 . Chr.27 : QTL:106669 . Chr.28 : QTL:106670 , QTL:106671 , QTL:106672 . Chr.29 : QTL:106673 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (6) ,
Chr.2 (5) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (9) ,
Chr.5 (6) ,
Chr.6 (17) ,
Chr.7 (12) ,
Chr.8 (18) ,
Chr.9 (9) ,
Chr.10 (11) ,
Chr.11 (8) ,
Chr.12 (10) ,
Chr.13 (12) ,
Chr.14 (6) ,
Chr.15 (7) ,
Chr.16 (6) ,
Chr.17 (8) ,
Chr.18 (7) ,
Chr.19 (10) ,
Chr.20 (11) ,
Chr.21 (3) ,
Chr.22 (8) ,
Chr.23 (6) ,
Chr.24 (3) ,
Chr.25 (7) ,
Chr.26 (8) ,
Chr.27 (7) ,
Chr.28 (9) ,
Chr.29 (7) .
Number of gene-based eQTL/associations:
