Authors: Sun Y, Li Q, Hu Y, Sun Y, Liu R, Zheng M, Wen J, Li P, Liu L, Zhao G
(Contact: zhaoguiping@caas.cn ) Affiliation: Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing, China Title: Genomewide association study of immune traits in chicken F2 resource population Journal: Journal Of Animal Breeding And Genetics, 133(3): 197-206 (2016)
DOI :
10.1111/jbg.12186 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Thymus weight
Chr.Z : Asso:101198 . Chr.1 : Asso:101180 , Asso:101181 , Asso:101182 , Asso:101183 , Asso:101184 , Asso:101185 , Asso:101186 , Asso:101187 , Asso:101267 , Asso:101268 . Chr.2 : Asso:101188 , Asso:101189 , Asso:101190 . Chr.3 : Asso:101191 . Chr.4 : Asso:101192 , Asso:101193 . Chr.10 : Asso:101194 , Asso:101195 , Asso:101196 . Chr.18 : Asso:101197 .
QTL for Spleen weight
Chr.5 : Asso:101199 , Asso:101270 . Chr.20 : Asso:101269 .
QTL for Bursa of Fabricius weight
Chr.Z : Asso:101260 . Chr.1 : Asso:101200 , Asso:101201 , Asso:101202 , Asso:101203 , Asso:101204 , Asso:101205 , Asso:101206 , Asso:101207 , Asso:101208 . Chr.2 : Asso:101209 , Asso:101210 , Asso:101211 , Asso:101212 , Asso:101213 , Asso:101214 , Asso:101215 , Asso:101216 , Asso:101217 , Asso:101218 . Chr.3 : Asso:101219 , Asso:101220 , Asso:101221 , Asso:101222 . Chr.4 : Asso:101223 , Asso:101224 , Asso:101225 . Chr.5 : Asso:101226 . Chr.6 : Asso:101227 , Asso:101228 , Asso:101229 , Asso:101230 . Chr.7 : Asso:101231 . Chr.9 : Asso:101232 , Asso:101233 , Asso:101234 , Asso:101235 . Chr.10 : Asso:101236 , Asso:101237 , Asso:101238 . Chr.12 : Asso:101239 . Chr.13 : Asso:101240 , Asso:101241 . Chr.14 : Asso:101242 . Chr.15 : Asso:101243 , Asso:101244 , Asso:101245 . Chr.17 : Asso:101246 . Chr.18 : Asso:101247 , Asso:101248 . Chr.20 : Asso:101249 , Asso:101250 . Chr.24 : Asso:101251 , Asso:101252 , Asso:101253 , Asso:101254 . Chr.26 : Asso:101255 , Asso:101256 , Asso:101257 , Asso:101258 . Chr.27 : Asso:101259 .
QTL for Hematocrit value
Chr.2 : Asso:101261 , Asso:101272 .
QTL for Red cell distribution width
Chr.Z : Asso:101262 , Asso:101263 , Asso:101277 .
QTL for Platelet count
Chr.2 : Asso:101264 , Asso:101274 .
QTL for Antibody titer to avian influenza virus
Chr.2 : Asso:101265 . Chr.5 : Asso:101266 .
QTL for Red blood cell count
Chr.28 : Asso:101271 .
QTL for Blood hemoglobin level
Chr.4 : Asso:101273 .
QTL for Plateletcrit
Chr.20 : Asso:101276 . Chr.23 : Asso:101275 .
QTL for Mean blood cell volume
Chr.3 : Asso:101278 .
QTL for Mean corpuscular hemoglobin concentration
Chr.2 : Asso:101279 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.Z (5) ,
Chr.1 (19) ,
Chr.2 (19) ,
Chr.3 (6) ,
Chr.4 (6) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (4) ,
Chr.7 (1) ,
Chr.9 (4) ,
Chr.10 (6) ,
Chr.12 (1) ,
Chr.13 (2) ,
Chr.14 (1) ,
Chr.15 (3) ,
Chr.17 (1) ,
Chr.18 (3) ,
Chr.20 (4) ,
Chr.23 (1) ,
Chr.24 (4) ,
Chr.26 (4) ,
Chr.27 (1) ,
Chr.28 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Sun Y, Li Q, Hu Y, Sun Y, Liu R, Zheng M, Wen J, Li P, Liu L, Zhao G (2016). Genomewide association study of immune traits in chicken F2 resource population. Journal of animal breeding and genetics, 133(3): 197-206;
Curated into QTLdb on 2016-06-23. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=TaOr5W5EdX
OR
Sun Y, Li Q, Hu Y, Sun Y, Liu R, Zheng M, Wen J, Li P, Liu L, Zhao G (2016). Genomewide association study of immune traits in chicken F2 resource population. Journal of animal breeding and genetics, 133(3): 197-206; DOI: https://dx.doi.org/10.1111/jbg.12186
