Authors: Tang Z, Xu J, Yin L, Yin D, Zhu M, Yu M, Li X, Zhao S, Liu X
(Contact: xiaoleiliu@mail.hzau.edu.cn ) Affiliation: Key Laboratory of Swine Genetics and Breeding, Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University, Wuhan, China Title: Genome-Wide Association Study Reveals Candidate Genes for Growth Relevant Traits in Pigs Journal: Frontiers In Genetics, 10: 302 (2019)
DOI :
10.3389/fgene.2019.00302 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Average daily gain
Chr.X : Asso:170902 . Chr.1 : Asso:170821 , Asso:170843 , Asso:170844 , Asso:170881 , Asso:170882 , Asso:170888 , Asso:170901 , Asso:170905 . Chr.2 : Asso:170862 , Asso:170865 , Asso:170886 , Asso:170889 , Asso:170904 . Chr.3 : Asso:170825 , Asso:170826 , Asso:170847 , Asso:170850 , Asso:170864 , Asso:170885 . Chr.6 : Asso:170822 , Asso:170846 , Asso:170849 . Chr.7 : Asso:170830 , Asso:170842 , Asso:170863 , Asso:170887 , Asso:170907 . Chr.8 : Asso:170841 . Chr.9 : Asso:170845 , Asso:170861 , Asso:170890 , Asso:170909 . Chr.10 : Asso:170823 . Chr.12 : Asso:170868 . Chr.13 : Asso:170824 , Asso:170828 , Asso:170829 , Asso:170883 , Asso:170906 . Chr.14 : Asso:170848 , Asso:170866 , Asso:170869 , Asso:170870 , Asso:170884 . Chr.15 : Asso:170908 . Chr.16 : Asso:170827 , Asso:170903 , Asso:170910 . Chr.17 : Asso:170867 .
QTL for Days to 100 kg
Chr.X : Asso:170919 , Asso:170920 . Chr.1 : Asso:170831 , Asso:170834 , Asso:170838 , Asso:170851 , Asso:170852 , Asso:170892 , Asso:170894 , Asso:170896 , Asso:170897 , Asso:170913 . Chr.2 : Asso:170871 , Asso:170914 . Chr.3 : Asso:170835 . Chr.4 : Asso:170840 . Chr.5 : Asso:170859 . Chr.6 : Asso:170833 , Asso:170854 , Asso:170857 , Asso:170879 . Chr.7 : Asso:170837 , Asso:170855 , Asso:170860 , Asso:170873 , Asso:170877 , Asso:170899 . Chr.8 : Asso:170832 . Chr.9 : Asso:170839 , Asso:170874 , Asso:170876 . Chr.10 : Asso:170895 . Chr.11 : Asso:170858 , Asso:170893 , Asso:170900 , Asso:170911 . Chr.12 : Asso:170875 , Asso:170912 . Chr.13 : Asso:170836 , Asso:170856 , Asso:170891 , Asso:170918 . Chr.14 : Asso:170872 , Asso:170878 , Asso:170915 . Chr.15 : Asso:170898 , Asso:170916 . Chr.16 : Asso:170880 . Chr.17 : Asso:170853 , Asso:170917 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (3) ,
Chr.1 (18) ,
Chr.2 (7) ,
Chr.3 (7) ,
Chr.4 (1) ,
Chr.5 (1) ,
Chr.6 (7) ,
Chr.7 (11) ,
Chr.8 (2) ,
Chr.9 (7) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.11 (4) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (9) ,
Chr.14 (8) ,
Chr.15 (3) ,
Chr.16 (4) ,
Chr.17 (3) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Tang Z, Xu J, Yin L, Yin D, Zhu M, Yu M, Li X, Zhao S, Liu X (2019). Genome-Wide Association Study Reveals Candidate Genes for Growth Relevant Traits in Pigs. Frontiers in genetics, 10: 302;
Curated into QTLdb on 2019-05-06. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=LaCj1Z9UiP
OR
Tang Z, Xu J, Yin L, Yin D, Zhu M, Yu M, Li X, Zhao S, Liu X (2019). Genome-Wide Association Study Reveals Candidate Genes for Growth Relevant Traits in Pigs. Frontiers in genetics, 10: 302; DOI: https://dx.doi.org/10.3389/fgene.2019.00302
