Authors: Nonneman D, Lindholm-Perry AK, Shackelford SD, King DA, Wheeler TL, Rohrer GA, Bierman CD, Schneider JF, Miller RK, Zerby H, Moe
(Contact: dan.nonneman@ars.usda.gov ) Affiliation: US Meat Animal Research Center, Clay Center, NE 68933, USA Title: Predictive markers in calpastatin for tenderness in commercial pig populations. Journal: Journal Of Animal Science, 89(9):2663-72 (2011)
DOI :
10.2527/jas.2010-3556 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Shear force
Chr.2 : Asso:17354 , Asso:17355 , Asso:17356 , Asso:17357 , Asso:17358 , Asso:17359 , Asso:17360 , Asso:17361 , Asso:17362 , Asso:17363 , Asso:17364 , Asso:17365 , Asso:17366 , Asso:17367 , Asso:17368 , Asso:17369 , Asso:17370 , Asso:17371 , Asso:17372 , Asso:17373 , Asso:17374 , Asso:17375 , Asso:17376 , Asso:17377 , Asso:17378 , Asso:17379 , Asso:17380 , Asso:17381 , Asso:17382 , Asso:17383 , Asso:17384 , Asso:17385 , Asso:17386 , Asso:17387 , Asso:17388 , Asso:17389 , Asso:17390 , Asso:17391 , Asso:17392 , Asso:17393 , Asso:17394 , Asso:17395 , Asso:17396 , Asso:17397 , Asso:17398 , Asso:17399 , Asso:17400 , Asso:17401 , Asso:17402 , Asso:17403 , Asso:17404 , Asso:17405 , Asso:17406 , Asso:17407 , Asso:17408 , Asso:17409 , Asso:17410 , Asso:17411 , Asso:17412 , Asso:17413 , Asso:17414 , Asso:17415 , Asso:17416 , Asso:17417 , Asso:17418 , Asso:17419 , Asso:17420 , Asso:17421 , Asso:17422 , Asso:17423 , Asso:17424 , Asso:17425 , Asso:17426 , Asso:17427 , Asso:17428 , Asso:17429 , Asso:17430 , Asso:17431 , Asso:17432 , Asso:17433 , Asso:17434 , Asso:17435 , Asso:17436 , Asso:17437 , Asso:17438 , Asso:17439 , Asso:17440 , Asso:17441 , Asso:17442 , Asso:17443 , Asso:17444 , Asso:17445 , Asso:17446 , Asso:17447 , Asso:17448 , Asso:17449 , Asso:17450 , Asso:17451 , Asso:17452 .
QTL for Juiciness score
Chr.2 : Asso:17453 , Asso:17458 , Asso:17462 , Asso:17464 , Asso:17467 , Asso:17471 , Asso:17473 , Asso:17476 , Asso:17483 , Asso:17487 , Asso:17491 , Asso:17495 .
QTL for Tenderness score
Chr.2 : Asso:17454 , Asso:17456 , Asso:17459 , Asso:17463 , Asso:17465 , Asso:17468 , Asso:17472 , Asso:17474 , Asso:17477 , Asso:17480 , Asso:17481 , Asso:17484 , Asso:17488 , Asso:17489 , Asso:17492 , Asso:17496 .
QTL for Chew score
Chr.2 : Asso:17455 , Asso:17457 , Asso:17466 , Asso:17475 , Asso:17482 , Asso:17490 .
QTL for Off-flavor score
Chr.2 : Asso:17460 , Asso:17469 , Asso:17478 , Asso:17485 , Asso:17493 .
QTL for Flavor score
Chr.2 : Asso:17461 , Asso:17470 , Asso:17479 , Asso:17486 , Asso:17494 .
QTL for Drip loss
Chr.2 : Asso:17497 , Asso:17499 , Asso:17501 , Asso:17503 , Asso:17504 , Asso:17506 , Asso:17507 , Asso:17509 , Asso:17510 , Asso:17512 , Asso:17513 , Asso:17514 , Asso:17516 , Asso:17517 , Asso:17518 , Asso:17519 , Asso:17521 , Asso:17523 .
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.2 : Asso:17498 .
QTL for Cooking loss
Chr.2 : Asso:17500 , Asso:17502 , Asso:17505 , Asso:17508 , Asso:17511 , Asso:17515 , Asso:17520 , Asso:17522 .
QTL for Fat percentage in carcass
Chr.2 : Asso:17524 , Asso:17527 , Asso:17530 , Asso:17533 , Asso:17536 .
QTL for Marbling
Chr.2 : Asso:17525 , Asso:17528 , Asso:17531 , Asso:17534 .
QTL for Intramuscular fat content
Chr.2 : Asso:17526 , Asso:17529 , Asso:17532 , Asso:17535 , Asso:17537 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Nonneman D, Lindholm-Perry AK, Shackelford SD, King DA, Wheeler TL, Rohrer GA, Bierman CD, Schneider JF, Miller RK, Zerby H, Moe (2011). Predictive markers in calpastatin for tenderness in commercial pig populations.. Journal of animal science, 89(9):2663-72;
Curated into QTLdb on 2012-07-12. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=EfBp5Y7WuH
OR
Nonneman D, Lindholm-Perry AK, Shackelford SD, King DA, Wheeler TL, Rohrer GA, Bierman CD, Schneider JF, Miller RK, Zerby H, Moe (2011). Predictive markers in calpastatin for tenderness in commercial pig populations.. Journal of animal science, 89(9):2663-72; DOI: https://dx.doi.org/10.2527/jas.2010-3556
