Authors: Biscarini F, Bovenhuis H, van Arendonk JA, Parmentier HK, Jungerius AP, van der Poel JJ
(Contact: filippo.biscarini@wur.nl ) Affiliation: Animal Breeding and Genomics Centre, Wageningen University, The Netherlands Title: Across-line SNP association study of innate and adaptive immune response in laying hens Journal: Animal Genetics, 41(1):26-38 (2010)
DOI :
10.1111/j.1365-2052.2009.01960.x Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Alternative complement activation by BRBC
Chr.3 : Asso:14513 , Asso:14517 , Asso:14520 , Asso:14523 . Chr.4 : Asso:14534 , Asso:14537 , Asso:14540 , Asso:14547 . Chr.5 : Asso:14555 , Asso:14556 , Asso:14558 , Asso:14559 , Asso:14563 , Asso:14564 , Asso:14578 , Asso:14580 . Chr.6 : Asso:14582 , Asso:14584 . Chr.7 : Asso:14590 , Asso:14592 , Asso:14603 , Asso:14604 . Chr.9 : Asso:14607 . Chr.13 : Asso:14616 . Chr.19 : Asso:14622 . Chr.21 : Asso:14624 . Chr.26 : Asso:14632 .
QTL for Antibody titer to KLH antigen
Chr.Z : Asso:14633 , Asso:14634 , Asso:14635 . Chr.3 : Asso:14514 . Chr.4 : Asso:14527 , Asso:14535 , Asso:14542 . Chr.5 : Asso:14551 , Asso:14553 , Asso:14567 , Asso:14568 , Asso:14569 , Asso:14570 , Asso:14571 , Asso:14575 . Chr.7 : Asso:14586 , Asso:14596 , Asso:14597 , Asso:14598 , Asso:14599 , Asso:14600 . Chr.13 : Asso:14609 , Asso:14610 , Asso:14611 , Asso:14612 , Asso:14613 . Chr.19 : Asso:14623 .
QTL for Antibody response to Newcastle disease virus
Chr.3 : Asso:14515 , Asso:14525 . Chr.4 : Asso:14533 , Asso:14536 , Asso:14545 . Chr.5 : Asso:14557 , Asso:14576 . Chr.9 : Asso:14605 . Chr.13 : Asso:14617 . Chr.16 : Asso:14621 . Chr.22 : Asso:14626 .
QTL for Classical complement activation by SRBC
Chr.3 : Asso:14516 , Asso:14519 , Asso:14522 . Chr.4 : Asso:14526 , Asso:14539 , Asso:14543 , Asso:14544 , Asso:14546 . Chr.5 : Asso:14552 , Asso:14554 , Asso:14562 , Asso:14566 , Asso:14573 , Asso:14574 , Asso:14577 . Chr.7 : Asso:14589 , Asso:14602 . Chr.9 : Asso:14606 . Chr.13 : Asso:14614 , Asso:14618 , Asso:14619 . Chr.22 : Asso:14627 . Chr.26 : Asso:14630 , Asso:14631 .
QTL for Antibody titer to LPS antigen
Chr.Z : Asso:14636 , Asso:14637 , Asso:14638 . Chr.3 : Asso:14518 , Asso:14521 , Asso:14524 . Chr.4 : Asso:14528 , Asso:14529 , Asso:14530 , Asso:14531 , Asso:14532 , Asso:14538 , Asso:14541 . Chr.5 : Asso:14560 , Asso:14561 , Asso:14565 , Asso:14572 . Chr.7 : Asso:14601 . Chr.13 : Asso:14608 , Asso:14615 . Chr.16 : Asso:14620 . Chr.22 : Asso:14625 . Chr.24 : Asso:14628 . Chr.26 : Asso:14629 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.Z (6) ,
Chr.3 (13) ,
Chr.4 (22) ,
Chr.5 (29) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (13) ,
Chr.9 (3) ,
Chr.13 (12) ,
Chr.16 (2) ,
Chr.19 (2) ,
Chr.21 (1) ,
Chr.22 (3) ,
Chr.24 (1) ,
Chr.26 (4) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Biscarini F, Bovenhuis H, van Arendonk JA, Parmentier HK, Jungerius AP, van der Poel JJ (2010). Across-line SNP association study of innate and adaptive immune response in laying hens. Animal Genetics, 41(1):26-38;
Curated into QTLdb on 2011-11-03. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=DtPx0K3AiU
OR
Biscarini F, Bovenhuis H, van Arendonk JA, Parmentier HK, Jungerius AP, van der Poel JJ (2010). Across-line SNP association study of innate and adaptive immune response in laying hens. Animal Genetics, 41(1):26-38; DOI: https://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2009.01960.x
